Perpustakaan yang ditulis dalam Nextflow
rnaseq
Pipa analisis pengurutan RNA menggunakan STAR, RSEM, HISAT2 atau Salmon dengan jumlah gen/isoform dan kontrol kualitas yang ekstensif..
- 646
- MIT
sarek
Pipeline analisis untuk mendeteksi germline atau varian somatik (pra-pemrosesan, pemanggilan varian, dan anotasi) dari WGS/pengurutan yang ditargetkan.
- 256
- MIT
configs
File konfigurasi yang digunakan untuk menentukan parameter khusus untuk menghitung lingkungan di Institusi yang berbeda (oleh nf-core).
- 71
- MIT